《三峡大学学报（自然科学版）》原名《武汉水利电力大学（宜昌）学报》是三峡大学主办的以水电工程技术为主的学术刊物。该刊物创办于1979年10月，刊名为《葛洲坝水电工程学院学报》，内部资料，半年刊；1994年6月被批准公开发行；1995年6月由半年刊改为季刊；1997年3月，由《葛洲坝水电工程学院学报》更名为《武汉水利电力大学（宜昌）学报》；2002年7月，经国家新闻出版总署批准由《武汉水利电力大学（宜昌）学报》更名为《三峡大学学报》；2004年6月，经科技部批准由《三峡大学学报》更名为《三峡大学学报（自然科学版）》。现为双月刊，国内外公开发行。自1998年第1期起入编《中国学术期刊（光盘版）》，1999年（用刊为1998年）被列入国家科技部中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊），2003年被俄罗斯《文摘杂志》,2005年被美国《化学文摘》，2007年被英国《INSPEC》（原名“科学文摘”）收录。自2003年起已有近600篇.次的论文被国内外重要数据库收录，社会影响较大。同时，学报还调整了对外发行计划，主动加强与全国各重点院校和协会、图书馆的联系和交流，现在全国各院校及各省级以上图书馆都可以阅读到三峡大学学报。2005年《三峡大学学报（自然科学版）》被评为湖北省优秀学报，2006,2010年两次被评为“中国高校特色科技期刊”。

《三峡大学学报（自然科学版）》学报办刊坚持有中国特色的社会主义方向，坚持党的四项基本原则，贯彻“双百”方针，广泛开展学术思想、科技交流，为我校教学与科研服务，为我国水电建设事业服务。学报立足三峡，面向全国，探索创新，注重理论联系实际，择优登载水利水电工程、建筑工程、机械工程、电气工程、管理工程以及基础科学等方面的文章，现设有“水电论坛，土木工程，机电工程，信息技术，环境工程，工程管理，化学与生命科学，数理研究”等8个栏目。学报特别注意及时发表三峡大学在防灾减灾、水利水电、边坡绿化、光纤监测等方面的最新研究成果，宣传、反映了三峡大学的科研水平。近年来，学报特色栏目“水电论坛”刊发了包括院士、教授、博导等一大批科研院所及工程单位的专家、学者的最新研究成果，取得了良好的社会反响。近三十年来，《三峡大学学报（自然科学版）》深受广大读者，特别是水电系统的工程技术人员及理工科高校师生的好评。获奖情况：湖北省优秀期刊；中国科技论文统计源期刊。

《三峡大学学报（人文社会科学版）》是湖北省教育厅主管、三峡大学主办的人文社会科学类学术理论刊物。本刊创办于1979年，双月刊，面向国内外公开发行，并与国外50多所高等学校和图书馆进行交流。本刊自创刊以来，发表过一大批名家、新秀的力作。有不少学术论文被《新华文摘》、《中国社会科学文摘》、《中国人民大学复印报刊资料》、《高等学校文科学术文摘》等国内权威文摘刊物复印、转载或摘录。2008年和2011年两次荣获“湖北省优秀期刊”。

《三峡大学学报（人文社会科学版）》坚持立足宜昌、融入三峡、依托湖北、面向全国、走向世界的办刊战略，奉行思想性、学术性、时代性、地域性的办刊原则，秉承以人为本、民主办刊、开放办刊的办刊理念。